Chordata 脊索動物門━Vertebrata 脊椎動物亜門┓
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┣A Agnatha 無顎上綱（むがく　2目 2科 12属 約84種）
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┗B Gnathostomata 顎口上綱（55目 479科 約4246属 約24535種）
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　┣A Chondrichthyes 軟骨魚綱（10目 45科 170属 約846種）
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　┃┗B Elasmobranchii 板鰓亜綱（9目 42科 164属 約815種）
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　┃　┣A Heterodontiformesネコザメ目（1科 1属 8種）
　┃　┃┗A Heterodontidae　Bullhead sharks　ネコザメ科（8種）
　┃　┣B Orectolobiformes テンジクザメ目（7科 14属 約31種）
　┃　┃┣A Parascyllidae クラカケザメ科（7種）
　┃　┃┣B Brachaeluridae プラカエルルス科（2種）
　┃　┃┣C Orectolo　Wobbegongs　旧テンジクザメ科
　┃　┃┣C Orectolobidae オオセ科に改名（6種）
　┃　┃┣D Hemiscyllii　Bamboo & Epaulette sharks　旧イヌザメ科
　┃　┃┣D Hemiscylliidae テンジクザメ科に改名（11種）
　┃　┃┣E Ginglymostomatidae　Nurse sharks　旧オオテンジクザメ科
　┃　┃┣E Ginglymostomatidaeコモリザメ科に改名（3種）
　┃　┃┣F Stegostomatidae　Zebra sharks　トラフザメ科（1種）
　┃　┃┗G Rhincodontidae　Whale sharks　ジンベエザメ科（1種）
　┃　┣C Carcharhiniformesメジロザメ目（7科 47属 約208種）
　┃　┃┣A Scyliorhinidae　Cat sharks　トラザメ科（約96種）
　┃　┃┣B Proscylliidae タイワンザメ科（6種）
　┃　┃┣C Pseudotriakidae オシザメ科（1種）
　┃　┃┣D Leptochariidae レプトカリアス科（1種）
　┃　┃┣E Triakidae ドチザメ科（39種）
　┃　┃┣F Hemigaleidae ヘーミーガレウス科（7種）
　┃　┃┗G Carcharhinidae　Requiem sharks　メジロザメ科（約58種）
　┃　┃　┗Sphyrnidae　Hammerhead sharks　シュモクザメ科
　┃　┃　　┗メジロザメ科に統合
　┃　┣D Lamniformes ネズミザメ目（7科 10属 16種）
　┃　┃┣A Odontaspididae　Sand tiger sharks　旧シロワニ科
　┃　┃┣A Odontaspididae オオワニザメ科（4種）
　┃　┃┣B Mitsukurinidae ミツクリザメ科（1種）
　┃　┃┣C Pseudocarchariidae ミズワニ科（1種）
　┃　┃┣D Megachasmidae メガマウス科（1種）
　┃　┃┣E Alopidae　Tresher sharks　オナガザメ科（3種）
　┃　┃┣F Cetorhinidae ウバザメ科（1種）
　┃　┃┗G Lamnidae　Mackerel sharks　ネズミザメ科（5種）
　┃　┣E Hexanchiformes カグラザメ目（2科 4属 5種）
　┃　┃┣A Chlamydoselachidae ラブカ科（1種）
　┃　┃┗B Hexanchidae　Six- & Sevengill sharks　カグラザメ科（4種）
　┃　┣F Squaliformesツノザメ目（4科 23属 約74種）
　┃　┃┣A Echinorhinidae キクザメ科（2種）
　┃　┃┣B Dalatiidae ヨロイザメ科（約49種）
　┃　┃┣C Centrophoridae アイザメ科（13種）
　┃　┃┗D Squalidae ツノザメ科（10種）
　┃　┣G Squatiniformes カスザメ目（1科 1属 12種）
　┃　┃┗A Squatinidae　Angel sharks　カスザメ科（12種）
　┃　┣H Pristiophorifo ノコギリザメ目（1科 2属 5種）
　┃　┃┗A Pristiophoridaeノコギリザメ科（5種）
　┃　┗I Rajiformes エイ目（4亜目 12科 62属 約456種）
　┃　　┣A Pristoidei ノコギリエイ亜目（1科 2属 6種）
　┃　　┃┗A Pristidae　Sawfishes　ノコギリエイ科（6種）
　┃　　┣B Torpedinoideiシビレエイ亜目（2科 11属 約38種）
　┃　　┃┣A Torpedini　Torpedo rays　旧シビレエイ科
　┃　　┃┣A Torpedinidae ヤマトシビレエイ科（約14種）
　┃　　┃┗B Narcinidae タイワンシビレエイ科（約24種）
　┃　　┣C Rajoidei ガンギエイ亜目（3科 27属 約251種）
　┃　　┃┣A Rhinidae シノノメサカタザメ科（約6種）
　┃　　┃┣B Rhynchobatidae　Sharkfin guitarfishes　サカタザメ科（約45種）
　┃　　┃┗C Rajidae ガンギエイ科（200種以上）
　┃　　┗D Myliobatoideiトビエイ亜目（6科 22属 約161種）
　┃　　　┣A Plesiobatidae ウスエイ科（1種）
　┃　　　┣B Hexatrygonidae ムツエラエイ科（1種）
　┃　　　┣C Dasyatididae　Stingrays　アカエイ科（70種）
　┃　　　┣D Urolophidae　Stingarees　ヒラタエイ科（約35種）
　┃　　　┣E Gymnuridae ツバクロエイ科（約12種）
　┃　　　┗F Myliobatidae　Eagle rays　トビエイ科（約42種）
　┃　　　　┣Rhinopteridae　Cownose rays　ウシバナトビエイ科
　┃　　　　┣Mobulidae　Devil rays　イトマキエイ科
　┃　　　　┃　┗Myliobatidae トビエイ科に編入
　┃　　　　┗どちらもトビエイ科に統合
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　┣B Sarcopterygii 肉鰭綱（にくき　3目 4科 4属 7種）
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　┗C Actinopterygii 条鰭魚綱（じょうき　42目 430科 約4072属 約23682種）
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　　┣A Chondrostei 軟質亜綱（2目 3科 8属 約36種）
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　　┗B Neopterygii 新鰭亜綱（しんき　40目 427科 約4072属 約23646種）